Selain mempunyai tenaga dosen dan pegawai yang professional dan berdedikasi, Stipar juga memiliki fasilitas-fasilitas pendidikan yang memadai untuk mewujudkan visi, misi, tujuan dan sasaran Stipar. Berikut ini adalah fasilitas-fasilitas Stipar Ende:
- Kampus yang strategis dan aman dengan ruang-ruang kuliah yang nyaman dan memadai.
- Perpustakaan yang memadai dengan koleksi buku, jurnal, majalah dan surat kabar sekaligus dilengkapi dengan ruang baca yang luas dan nyaman.
- Ruang komputer dan fasilitas internet yang memadai.
- Laboratorium Katekese-Pastoral dan audio-visual serta peralatan musik liturgi.
- Kapel yang dilengkapi dengan sarana ibadat.
- Asrama untuk mahasiswa dan mahasiswi dengan fasilitas yang memadai, yang letaknya di lingkungan Kampus Stipar
- Aula yang nyaman untuk berbagai kegiatan umum Stipar.
- Lahan dan fasilitas kerja yang memadai untuk pendidikan keterampilan kerja.