Selain mempunyai tenaga dosen dan pegawai yang professional dan berdedikasi, Stipar juga memiliki fasilitas-fasilitas pendidikan yang memadai untuk mewujudkan visi, misi, tujuan dan sasaran Stipar. Berikut ini adalah fasilitas-fasilitas Stipar Ende:

1. Kampus yang strategis dan aman dengan ruang-ruang kuliah yang nyaman dan memadai.
2. Perpustakaan yang memadai dengan koleksi buku, jurnal, majalah dan surat kabar sekaligus dilengkapi dengan ruang baca yang luas dan nyaman.
3. Ruang komputer dan fasilitas internet yang memadai.
4. Laboratorium Katekese-Pastoral dan audio-visual serta peralatan musik liturgi.
5. Kapel yang dilengkapi dengan sarana ibadat.
6. Asrama untuk mahasiswa dan mahasiswi dengan fasilitas yang memadai, yang letaknya di lingkungan Kampus Stipar
7. Aula yang nyaman untuk berbagai kegiatan umum Stipar.
8. Lahan dan fasilitas kerja yang memadai untuk pendidikan keterampilan kerja.